Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CETPP11597 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CETPP11597 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CETPP11597 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CETPP11597 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CETPP11597 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CETPP11597 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CETPP11597 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CETPP11597 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CETPP11597 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CETPP11597 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CETPP11597 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CETPP11597 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CETPP11597 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CETPP11597 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CETPP11597 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CETPP11597 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CETPP11597 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CETPP11597 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CETPP11597 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CETPP11597 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CETPP11597 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CETPP11597 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CETPP11597 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CETPP11597 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CETPP11597 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CETPP11597 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CETPP11597 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CETPP11597 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CETPP11597 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CETPP11597 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CETPP11597 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CETPP11597 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CETPP11597 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CETPP11597 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CETPP11597 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CETPP11597 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CETPP11597 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CETPP11597 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CETPP11597 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CETPP11597 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CETPP11597 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CETPP11597 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CETPP11597 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CETPP11597 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CETPP11597 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CETPP11597 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CETPP11597 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CETPP11597 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CETPP11597 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms