Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMC1P11047 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LAMC1P11047 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMC1P11047 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LAMC1P11047 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMC1P11047 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMC1P11047 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAMC1P11047 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMC1P11047 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMC1P11047 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAMC1P11047 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAMC1P11047 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMC1P11047 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMC1P11047 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LAMC1P11047 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMC1P11047 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMC1P11047 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LAMC1P11047 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LAMC1P11047 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMC1P11047 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LAMC1P11047 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LAMC1P11047 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LAMC1P11047 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMC1P11047 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMC1P11047 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LAMC1P11047 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMC1P11047 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LAMC1P11047 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMC1P11047 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMC1P11047 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LAMC1P11047 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMC1P11047 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMC1P11047 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
LAMC1P11047 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LAMC1P11047 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LAMC1P11047 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMC1P11047 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMC1P11047 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LAMC1P11047 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMC1P11047 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LAMC1P11047 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LAMC1P11047 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMC1P11047 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LAMC1P11047 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMC1P11047 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LAMC1P11047 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
LAMC1P11047 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms