Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD8BP10966 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD8BP10966 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD8BP10966 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD8BP10966 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD8BP10966 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD8BP10966 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD8BP10966 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD8BP10966 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD8BP10966 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD8BP10966 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD8BP10966 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD8BP10966 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD8BP10966 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD8BP10966 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD8BP10966 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD8BP10966 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms