Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47B1P0C2W7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47B1P0C2W7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms