Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DQB1P01920 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DQB1P01920 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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