Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3O95983 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3O95983 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3O95983 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3O95983 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD3O95983 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD3O95983 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD3O95983 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD3O95983 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD3O95983 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD3O95983 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD3O95983 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD3O95983 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD3O95983 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD3O95983 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD3O95983 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD3O95983 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD3O95983 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD3O95983 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD3O95983 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD3O95983 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD3O95983 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD3O95983 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD3O95983 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD3O95983 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD3O95983 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD3O95983 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms