Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms