Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms