Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEFVO15553 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEFVO15553 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEFVO15553 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEFVO15553 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEFVO15553 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEFVO15553 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEFVO15553 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEFVO15553 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEFVO15553 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEFVO15553 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MEFVO15553 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEFVO15553 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEFVO15553 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MEFVO15553 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEFVO15553 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEFVO15553 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEFVO15553 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEFVO15553 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEFVO15553 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEFVO15553 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEFVO15553 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEFVO15553 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEFVO15553 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEFVO15553 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEFVO15553 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEFVO15553 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEFVO15553 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEFVO15553 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEFVO15553 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEFVO15553 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEFVO15553 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEFVO15553 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEFVO15553 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEFVO15553 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEFVO15553 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEFVO15553 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEFVO15553 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEFVO15553 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEFVO15553 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MEFVO15553 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEFVO15553 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEFVO15553 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEFVO15553 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MEFVO15553 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEFVO15553 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEFVO15553 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEFVO15553 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEFVO15553 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEFVO15553 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEFVO15553 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEFVO15553 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MEFVO15553 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEFVO15553 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEFVO15553 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEFVO15553 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEFVO15553 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEFVO15553 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEFVO15553 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEFVO15553 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEFVO15553 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEFVO15553 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MEFVO15553 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEFVO15553 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEFVO15553 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEFVO15553 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEFVO15553 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEFVO15553 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MEFVO15553 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MEFVO15553 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MEFVO15553 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MEFVO15553 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MEFVO15553 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MEFVO15553 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MEFVO15553 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms