Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1AO15047 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms