Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOBPA7XYQ1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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