Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms