Protein–RNA interactions for Protein: A6NIX2

WTIP, Wilms tumor protein 1-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WTIPA6NIX2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WTIPA6NIX2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WTIPA6NIX2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms