Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF22A3QJZ6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms