Protein–RNA interactions for Protein: A0ZSE6

TMEM30CP, Cell cycle control protein 50C, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CPA0ZSE6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM30CPA0ZSE6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms