Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NLRP3Q96P20 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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