Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FXNQ16595 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FXNQ16595 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms