Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms