Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MIAT-218ENST00000613780 10143 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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HERC1Q15751 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 SNHG14-210ENST00000546682 8842 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 FAM26E-201ENST00000368599 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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HERC1Q15751 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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HERC1Q15751 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
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