Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SIX1Q15475 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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