Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AC138904.2-201ENST00000614412 107 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 RN7SKP89-201ENST00000410774 242 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 SNX18P14-201ENST00000429308 574 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AC023886.1-201ENST00000506057 685 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AC006070.1-201ENST00000508151 193 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 OR7E96P-201ENST00000530816 976 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AC023595.1-201ENST00000536216 564 ntTSL 4 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 RN7SL25P-201ENST00000583862 260 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AC005518.2-201ENST00000603254 282 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 Metazoa_SRP.167-201ENST00000614947 260 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NBR1Q14596 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 PCOTH-201ENST00000382133 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 TRBV6-6-201ENST00000390371 388 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 RNA5SP297-201ENST00000391029 113 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AL049646.2-201ENST00000436848 258 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AL137027.1-201ENST00000440358 444 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC015820.1-201ENST00000473882 321 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NBR1Q14596 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms