Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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DDX39BQ13838 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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DDX39BQ13838 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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DDX39BQ13838 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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