Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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