Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
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CUL3Q13618 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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CUL3Q13618 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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CUL3Q13618 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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CUL3Q13618 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CUL3Q13618 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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