Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LCHNA4D1U4 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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