Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP35Q9P2H5 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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