Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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SH3BP4Q9P0V3 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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SH3BP4Q9P0V3 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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