Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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FOXQ1Q9C009 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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FOXQ1Q9C009 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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FOXQ1Q9C009 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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