Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms