Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CDKN3Q16667 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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