Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ALCAMQ13740 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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