Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms