Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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TOP3AQ13472 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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TOP3AQ13472 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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TOP3AQ13472 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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TOP3AQ13472 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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TOP3AQ13472 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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TOP3AQ13472 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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TOP3AQ13472 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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TOP3AQ13472 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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