Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms