Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms