Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
ARID4AP29374 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms