Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTPRMP28827 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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