Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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