Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD8P13378 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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