Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms