Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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ZNF548Q8NEK5 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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ZNF548Q8NEK5 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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