Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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