Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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CHD4Q14839 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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CHD4Q14839 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
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CHD4Q14839 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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CHD4Q14839 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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CHD4Q14839 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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CHD4Q14839 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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