Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
NEUROD1Q13562 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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