Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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TCOF1Q13428 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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TCOF1Q13428 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
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TCOF1Q13428 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
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