Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MAPK10-272ENST00000641110 2724 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 LINC00208-201ENST00000304233 2150 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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