Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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