Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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LMOD1P29536 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
LMOD1P29536 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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LMOD1P29536 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMOD1P29536 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMOD1P29536 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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LMOD1P29536 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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LMOD1P29536 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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LMOD1P29536 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMOD1P29536 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMOD1P29536 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMOD1P29536 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMOD1P29536 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LMOD1P29536 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMOD1P29536 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMOD1P29536 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
LMOD1P29536 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMOD1P29536 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMOD1P29536 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMOD1P29536 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LMOD1P29536 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LMOD1P29536 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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