Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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