Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.9 ms